侯祐堂（1919~2010）女。高陽河西村人。地質學家侯德封之女。1944年畢業于重慶大學地質系。1944年8月至1946年8月在四川地質調查所任技佐。1946年9月至1947年1月在南京金陵女子文理學院任助教。1947年2月至1951年4月在南京原中央研究院地質研究所圖書館從事圖書管理工作。1951年5月至1989年5月在中國科學院南京地質古生物研究所先后任研究實習員、助理研究員、副研究員、研究員。1956年加入中國共產黨。

曾任中國科學院南京地質古生物研究所石油研究室副主任、第五研究室副主任、主任，江蘇省第三屆至第六屆人大代表，江蘇省及南京市婦聯常委，中國第四紀委員會常務委員、名譽委員，中國古生物學會理事，微體古生物學會副理事長及介形類學科委員會主任，中國甲殼動物學會副理事長。1960年獲地質古生物研究所躍進獎一等獎。1979年擔任中國古生物學會與科學出版社聯合組成的《古生物學基礎理論叢書》及《古生物學論著叢書》編輯委員會委員。1983年被國務院學位委員會批準為博士生導師。

侯祐堂是我國第一個開展微體化石介形類研究的科學家，撰寫的《遼東省下奧陶紀介形類化石》是中國學者發表的第一篇介形類古生物學論文。先后領導和參加了三個大的有關石油地質的科研工作，為我國陸相盆地及沿海大陸架的油田預測提供了重要的基礎地質古生物資料。研究成果在中國石油天然氣地質勘探開發中應用很廣泛，成效很大。對介形類古生物及其有關的地層研究較有成就，特別是對介形類古生物的分類研究和中新生代地層方面的工作成績突出。

以侯祐堂為首參與編著的《江蘇地區白堊紀—第四紀介形類動物群》和《渤海沿岸地區早第三紀介形類》等，是中國學者所寫的篇幅最大、內容最豐富的介形蟲古生物學與生物地層學專著。為中國科研、教學、生產部門培養大批介形類古生物學工作者做了大量工作。獨著或合著有《中國介形蟲化石層位的分布》、《中國的介形類化石》、《關于中國新生代地層的劃分對比問題》、《渤海沿岸地區早第三紀介形類》等。2010年1月18日在南京逝世。